对埃索美拉唑中任一成分过敏的患者不可使用该药品治疗。 埃索美拉唑可能会导致胎儿毒性，对胎儿产生危害，因此患者在接受该药品治疗期间应使用有效的非激素避孕方法。已经怀孕的患者应在治疗前告知医生，医生会根据患者的病情为其提出最佳治疗方案。尚不明确埃索美拉唑是否会经人乳排泄，因此在哺乳期间不建议使用该药品治疗。长期使用埃索美拉唑治疗可能导致维生素B12吸收不良，并随后导致维生素B12缺乏。缺乏的程度与用药剂量有关，停止该药品的治疗后患病率下降。