特泊替尼会引起白细胞降低，主要与药物不良反应有关，具体的机制尚不明确，可能与特泊替尼导致骨髓抑制有关，容易引起血小板减少、白细胞减少、贫血等血液系统副作用。
除此之外，特泊替尼还会引起周围性水肿、恶心、呕吐、腹泻、血肌酐升高、乏力、淀粉酶增加、ALT升高、AST升高，以及低白蛋白血症、脂肪酶增加、疲劳等副作用。